Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRCC1Q9NPI7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRCC1Q9NPI7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRCC1Q9NPI7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRCC1Q9NPI7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRCC1Q9NPI7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRCC1Q9NPI7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms