Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A4GALTQ9NPC4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms