Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE7BQ9NP56 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms