Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMURF2Q9HAU4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms