Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRDE2Q9H7Z3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms