Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC6A16Q9GZN6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A16Q9GZN6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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