Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms