Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP1Q9C000 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms