Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
KRTAP3-1Q9BYR8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms