Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms