Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms