Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIRIP3Q9BW71 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms