Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM43Q9BTV4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms