Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRACR2AQ9BSW2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms