Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms