Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC9Q96Q05 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms