Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms