Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRT1Q96EB6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms