Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms