Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms