Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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