Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC112Q8NEF3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms