Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AVL9Q8NBF6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AVL9Q8NBF6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms