Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD53Q8N9V6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms