Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms