Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR53Q7Z5U6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms