Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC2Q7Z4H3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms