Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms