Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP54Q7Z3B4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms