Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L1Q7RTZ2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms