Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECW1Q76N89 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms