Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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