Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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USP34Q70CQ2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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USP34Q70CQ2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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USP34Q70CQ2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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USP34Q70CQ2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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USP34Q70CQ2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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