Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRPF8Q6P2Q9 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.189e-8■■■■■ 28.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.299e-8■■■■■ 28.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.379e-8■■■■■ 28.5
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PRPF8Q6P2Q9 ATF2-206ENST00000409635 2109 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.215e-7■■■■■ 28.5
PRPF8Q6P2Q9 ATF2-219ENST00000456655 1861 ntTSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 28.5
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PRPF8Q6P2Q9 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.65e-7■■■■■ 28.5
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PRPF8Q6P2Q9 TATDN1-217ENST00000523214 1134 ntTSL 1 (best)5.57□□□□□ -1.521e-10■■■■■ 28.5
PRPF8Q6P2Q9 TATDN1-208ENST00000520321 629 ntTSL 55.01□□□□□ -1.611e-10■■■■■ 28.5
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