Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms