Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms