Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms