Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC93Q567U6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms