Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms