Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP28Q4G0W2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms