Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms