Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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