Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms