Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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E2F4Q16254 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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E2F4Q16254 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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E2F4Q16254 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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E2F4Q16254 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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E2F4Q16254 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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E2F4Q16254 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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E2F4Q16254 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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E2F4Q16254 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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