Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms