Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TLR1Q15399 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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