Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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