Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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NFIXQ14938 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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NFIXQ14938 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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NFIXQ14938 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIXQ14938 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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