Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SMCO1Q147U7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms