Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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